Keterampilan proses sains menunjang siswa dalam menemukan, membangun, dan memperluas konsep mengenai ilmu pengetahuan alam. Pembelajaran menggunakan media akan memfasilitasi dalam memahami konsep materi dengan baik. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan media pembelajaran mengikuti tahapan model 4D. Langkah - langkah pengembangan terdiri dari: (a) define; (b) design; (c) develop; (d) disseminate. Temuan yang diperoleh dalam penelitian ini, yaitu: (a) Hasil produk media pembelajaran berupa ensiklopedia sains (E-Sains) berbasis web dapat diakses melalui online browser, memiliki empat menu, dan terdapat 60 jenis varian hewan dan tumbuhan; (b) E-sains telah dinyatakan layak sebagai media pembelajaran berdasarkan hasil validasi ahli materi, media, bahasa dan teknologi dengan nilai rata-rata 91,77%. Hasil uji coba produk one-to-one memperoleh nilai 80%, small group memperoleh nilai 85%, large group memperoleh nilai 90%, artinya semua penilaian berada pada kategori layak; (c) Pengujian efektivitas menggunakan desain one group pretest-posttest menggunakan prosedur tes t dan N-Gain. Dari hasil tes t diperoleh nilai signifikansi (2-tailed) 0,00