Hasil dari pendidikan yang bermutu salah satunya dapat dilihat dari output prestasi yang telah diraih oleh peserta didik, baik dalam prestasi bidang akademik maupun non akademik. Salah satu parameter dari sekolah yang bermutu adalah bagaimana sekolah mampu mengelola program unggulan yang dimilikinya dalam fungsi manajemen mulai proses perencanaan, pengorganisasian, pelaksanaan dan evaluasi terhadap program unggulan sekolah yang akhirnya menjadi branding bagi sekolah sehingga sekolah dapat dipercaya oleh masyarakat dalam menitipkan putra putri mereka. Penelitian ini dilakukan di SMA Islam Terpadu (SMAIT) Thariq Bin Ziyad Bekasi yang menerapkan program unggulan sekolah dalam simpul Akhlak, Al Quran, Akademik dan Bahasa (A3B), Dalam program unggulan akhlak melaksanakan program Bina Pribadi Islami (BPI), program unggulan tahsin dan tahfizh Al Quran, program unggulan akademik dalam studi lanjut serta program unggulan bahasa dalam program TOEFL. Metode penelitian menggunakan kualitatif deskriptif dengan cara observasi, wawancara dengan key informan yaitu kepala sekolah dan penanggungjawab program unggulan A3B serta informan pendukung dengan peserta didik dan orang tua, selanjutnya melakukan studi dokumentasi. Data yang telah diperoleh direduksi lalu disajikan dalam bentuk hasil dan pembahasan. Hasil dari penelitian ini adalah dimulai dari perencanaan program unggulan berdasarkan visi sekolah, pada pengorganisasian adanya tanggungjawab dan garis koordinasi antara penanggungjawab program unggulan A3B dengan kepala sekolah. Pada pelaksanaan sesuai dengan apa yang sudah direncanakan dan pada tahap evaluasi dilalukan secara berkala oleh penanggungjawab program unggulan A3B. Implikasi dengan adanya manajemen terhadap program unggulan di SMAIT Thariq Bin Ziyad maka output peserta didik berprestasi dan tingginya tingkat kepercayaan stakeholder orang tua pada SMAIT Thariq Bin Ziyad Bekasi yang terlihat pada suksesnya kegiatan Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB). Kata kunci: manajemen, program unggulan, sekolah bermutu