Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji praktik pengelolaan human capitalAPIP (Aparat Pengawasan Internal Pemerintah) di lingkungan Kementerian Pertahanan Republik Indonesia dengan menggunakan pendekatan balanced scorecardyang telah dimodifikasi keempat perspektifnya dari aslinya menjadiperspektif stakeholder, perspektif internal bisnis process, perspektif learning and growthserta perspektif budgettingsehingga kualitas kinerja dari APIP sebagai organisasi pengawasinternal dapat sepenuhnya mendukung pencapaian visi dan misi organisasi. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode kualitatif dengan tipe studi kasus menggunakan purposivedan snowball samplingdengan teknik pengumpulan data meliputi studi dokumentasi, wawancara, dan observasi. Hasil penelitian terhadap masing-masing perspektif balanced scorecardmenemukan bahwa kinerja APIP belum optimal dalam mendukung pencapaian visi dan misi serta tujuan organisasi terutama disebabkan kualitas sumber daya manusia yang belum optimal, terutama auditor APIP sebagai ujung tombak yang berperan penting menentukan pencapaian kinerja organisasi. Rekomendasi penelitian yang diberikan antara lain pentingnya peningkatan aspek kompetensi SDM melalui pendidikan dan pelatihan sertifikasi jabatan fungsional auditor (JFA) sesuai jenjang jabatan, perbaikan struktur organisasi, peningkatan kualitas kode etik, dan perbaikan sistem rekruitmen, pengelolaan kinerjadan pengembangan karier serta upaya meningkatkan anggaran sesuai kebutuhan operasional serta membina human capitalAPIP dengan tujuan agar kualitas APIP sebagai organisasi pengawas internal dapat mencapai kualitas kelas dunia.Kata Kunci :Human Capital Management, AparatPengawas Internal Pemerintah, dan Balanced Scorecard.